Портативна лабораторія для секвенування днк

Відео: 3Д друк зі смартфона | Мобільний льох | Переносна лабораторія (техНашествіе №76)

Незабаром після початку програми зі створення портативного пристрою для секвенування ДНК MinION Access Programme (MAP) з`явилися перші плоди роботи.

Центр геномного аналізу (TGAC) поділився з медичними виданнями своїм результатом - вражаючою технологією, яка дозволить в недалекому майбутньому вивчати генетичний код будь-якого живої істоти мало не на дому.

Сьогодні TGAC планує використовувати портативну лабораторію для секвенування ДНК з метою проведення екологічного моніторингу.

Замість тривалого і копіткого збору зразків та подальшої доставки в лабораторію тепер вчені зможуть прямо на місці, в польових умовах проводити необхідні генетичні аналізи. А можливості новинки в області медицини відкриваються просто приголомшливі, хоча пристрій розроблявся не для цього.

Дослідники з групи з вивчення інфраструктури даних і алгоритмів рослинного і мікробного геному TGAC провели велику роботу по випробуванню і мініатюрізірованію сенсорної системи, яка на ходу аналізує генетичний код зразків ДНК від будь-якого їх сотень тисяч живих організмів.

В першу чергу співробітники TGAC експериментували з мікробним співтовариством, взявши простий набір ДНК від 20 бактерій, створених в рамках Проекту людського мікробіома (Human Microbiome Project). Використовуючи експериментальну технологію обробки даних, вони успішно секвенувати ДНК всіх зразків за допомогою платформи MinION від Illumina.

Головною метою вчених було створення зручного і простого методу для аналізу ДНК будь-яких живих істот навколо нас - бактерій, грибків, вірусів і ін. Багато захворювань сільськогосподарських культур, а також хвороби людини і тварин тепер можна швидко ідентифікувати навіть за тими зразками, які містять мінімальну кількість біологічного матеріалу - наприклад, за зразком повітря.

Доктор Леггетт, один з творців технології, каже: «Наша робота все ще на ранній стадії, але пристрій MinION продемонструвало відмінні результати при роботі зі зразками бактерій. Пристрій може працювати на базі малопотужного одноплатного комп`ютера (Raspberry Pi) »

Винахідники віддали перевагу влаштуванню MinION в даній області досліджень через оптимального співвідношення ціна / ефективність, простоти і мініатюрних розмірів. Хоча на сьогодні у новинки недостатньо висока надійність (зрідка можуть виникати помилки), вчені говорять, що це все одно дуже непогано, якщо врахувати його розміри. Вони впевнені, що після деякого доопрацювання MinION стане надійним інструментом для генетичного аналізу.